Protein–RNA interactions for Protein: Q99835

SMO, Smoothened homolog, humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMOQ99835 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMOQ99835 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMOQ99835 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMOQ99835 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMOQ99835 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMOQ99835 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMOQ99835 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMOQ99835 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMOQ99835 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMOQ99835 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMOQ99835 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMOQ99835 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMOQ99835 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SMOQ99835 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMOQ99835 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SMOQ99835 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMOQ99835 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SMOQ99835 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMOQ99835 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMOQ99835 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMOQ99835 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMOQ99835 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMOQ99835 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMOQ99835 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMOQ99835 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMOQ99835 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMOQ99835 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMOQ99835 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMOQ99835 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMOQ99835 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMOQ99835 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SMOQ99835 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMOQ99835 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMOQ99835 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMOQ99835 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMOQ99835 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMOQ99835 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMOQ99835 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SMOQ99835 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMOQ99835 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMOQ99835 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMOQ99835 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMOQ99835 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMOQ99835 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMOQ99835 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMOQ99835 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMOQ99835 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMOQ99835 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMOQ99835 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMOQ99835 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMOQ99835 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMOQ99835 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMOQ99835 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMOQ99835 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMOQ99835 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMOQ99835 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMOQ99835 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMOQ99835 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMOQ99835 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMOQ99835 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMOQ99835 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMOQ99835 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMOQ99835 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMOQ99835 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMOQ99835 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMOQ99835 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMOQ99835 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMOQ99835 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMOQ99835 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMOQ99835 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMOQ99835 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMOQ99835 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMOQ99835 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMOQ99835 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMOQ99835 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMOQ99835 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMOQ99835 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMOQ99835 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMOQ99835 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMOQ99835 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMOQ99835 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMOQ99835 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMOQ99835 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMOQ99835 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMOQ99835 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMOQ99835 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMOQ99835 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMOQ99835 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMOQ99835 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SMOQ99835 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMOQ99835 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMOQ99835 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMOQ99835 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMOQ99835 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMOQ99835 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMOQ99835 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMOQ99835 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SMOQ99835 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMOQ99835 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMOQ99835 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms