Protein–RNA interactions for Protein: Q96LL4

C8orf48, Uncharacterized protein C8orf48, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf48Q96LL4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C8orf48Q96LL4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C8orf48Q96LL4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms