Protein–RNA interactions for Protein: Q96JE7

SEC16B, Protein transport protein Sec16B, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16BQ96JE7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC16BQ96JE7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SEC16BQ96JE7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC16BQ96JE7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC16BQ96JE7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC16BQ96JE7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC16BQ96JE7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC16BQ96JE7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC16BQ96JE7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC16BQ96JE7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC16BQ96JE7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC16BQ96JE7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC16BQ96JE7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC16BQ96JE7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC16BQ96JE7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC16BQ96JE7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC16BQ96JE7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC16BQ96JE7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC16BQ96JE7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC16BQ96JE7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC16BQ96JE7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC16BQ96JE7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC16BQ96JE7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC16BQ96JE7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC16BQ96JE7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC16BQ96JE7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC16BQ96JE7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC16BQ96JE7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC16BQ96JE7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC16BQ96JE7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC16BQ96JE7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC16BQ96JE7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC16BQ96JE7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC16BQ96JE7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC16BQ96JE7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC16BQ96JE7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC16BQ96JE7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC16BQ96JE7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC16BQ96JE7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC16BQ96JE7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC16BQ96JE7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC16BQ96JE7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC16BQ96JE7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC16BQ96JE7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC16BQ96JE7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms