Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CELF1Q92879 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CELF1Q92879 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CELF1Q92879 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CELF1Q92879 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CELF1Q92879 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CELF1Q92879 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CELF1Q92879 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CELF1Q92879 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CELF1Q92879 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CELF1Q92879 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CELF1Q92879 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms