Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
LRRC9Q6ZRR7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
LRRC9Q6ZRR7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
LRRC9Q6ZRR7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
LRRC9Q6ZRR7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
LRRC9Q6ZRR7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LRRC9Q6ZRR7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
LRRC9Q6ZRR7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
LRRC9Q6ZRR7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
LRRC9Q6ZRR7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
LRRC9Q6ZRR7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
LRRC9Q6ZRR7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LRRC9Q6ZRR7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LRRC9Q6ZRR7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LRRC9Q6ZRR7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LRRC9Q6ZRR7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
LRRC9Q6ZRR7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LRRC9Q6ZRR7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LRRC9Q6ZRR7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
LRRC9Q6ZRR7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
LRRC9Q6ZRR7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
LRRC9Q6ZRR7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
LRRC9Q6ZRR7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
LRRC9Q6ZRR7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
LRRC9Q6ZRR7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC33.8■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC33.77■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
LRRC9Q6ZRR7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
LRRC9Q6ZRR7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms