Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS37

NHLRC3, NHL repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3Q5JS37 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NHLRC3Q5JS37 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLRC3Q5JS37 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.3 ms