Protein–RNA interactions for Protein: Q05541

NSE3, Non-structural maintenance of chromosome element 3, yeast

Predictions only

Length 303 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NSE3	Q05541	YBL113W-A	YBL113W-A	483 nt		5.44	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	YOR396C-A	YOR396C-A	483 nt		5.44	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	YPL283W-B	YPL283W-B	483 nt		5.44	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	YPR204C-A	YPR204C-A	483 nt		5.44	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	CBP6	YBR120C	489 nt		5.44	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	OPY1	YBR129C	987 nt		5.44	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	YHR182W	YHR182W	2358 nt		5.44	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	STP4	YDL048C	1473 nt		5.44	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	YRB30	YGL164C	1323 nt		5.44	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	YJL206C	YJL206C	2277 nt		5.44	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	YND1	YER005W	1893 nt		5.43	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	YCL075W	YCL075W	441 nt		5.43	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	ATP16	YDL004W	483 nt		5.43	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	ZRT1	YGL255W	1131 nt		5.43	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	GRX5	YPL059W	453 nt		5.43	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	OXR1	YPL196W	822 nt		5.43	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	YHR202W	YHR202W	1809 nt		5.43	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	SUP45	YBR143C	1314 nt		5.43	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	URC2	YDR520C	2319 nt		5.42	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	KEX1	YGL203C	2190 nt		5.42	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	SBE2	YDR351W	2595 nt		5.42	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	PHO87	YCR037C	2772 nt		5.42	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	YFR045W	YFR045W	930 nt		5.42	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	RNA15	YGL044C	891 nt		5.42	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	RSM27	YGR215W	333 nt		5.42	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	YJL218W	YJL218W	591 nt		5.42	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	FMP46	YKR049C	402 nt		5.42	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	CSM3	YMR048W	954 nt		5.42	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	FAA3	YIL009W	2085 nt		5.42	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	PHM7	YOL084W	2976 nt		5.42	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	STV1	YMR054W	2673 nt		5.41	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	TGL4	YKR089C	2733 nt		5.41	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	ZPR1	YGR211W	1461 nt		5.41	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	RIP1	YEL024W	648 nt		5.41	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	YRA2	YKL214C	612 nt		5.41	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	SMD2	YLR275W	333 nt		5.41	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	NKP2	YLR315W	462 nt		5.41	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	YBL068W-A	YBL068W-A	237 nt		5.41	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	MFM1	YPL060W	1242 nt		5.41	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	YMR221C	YMR221C	1515 nt		5.41	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	EUG1	YDR518W	1554 nt		5.41	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	GCR1	YPL075W	2358 nt		5.41	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	MNT2	YGL257C	1677 nt		5.4	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	NUR1	YDL089W	1455 nt		5.4	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	UBP10	YNL186W	2379 nt		5.4	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	RPS11A	YDR025W	471 nt		5.4	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	YGL117W	YGL117W	798 nt		5.4	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	PRE9	YGR135W	777 nt		5.4	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	COS8	YHL048W	1146 nt		5.4	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	YHR173C	YHR173C	339 nt		5.4	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	CAB2	YIL083C	1098 nt		5.4	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	GTT1	YIR038C	705 nt		5.4	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	YAE1	YJR067C	426 nt		5.4	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	YLR444C	YLR444C	303 nt		5.4	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	PPG1	YNR032W	1107 nt		5.4	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	BUB3	YOR026W	1026 nt		5.4	□□□□□ -1.54
NSE3	Q05541	SPS2	YDR522C	1509 nt		5.39	□□□□□ -1.55
NSE3	Q05541	CDC6	YJL194W	1542 nt		5.39	□□□□□ -1.55
NSE3	Q05541	SWC3	YAL011W	1878 nt		5.39	□□□□□ -1.55
NSE3	Q05541	SNU23	YDL098C	585 nt		5.39	□□□□□ -1.55
NSE3	Q05541	YGR269W	YGR269W	327 nt		5.39	□□□□□ -1.55
NSE3	Q05541	FMC1	YIL098C	468 nt		5.39	□□□□□ -1.55
NSE3	Q05541	CSI1	YMR025W	888 nt		5.39	□□□□□ -1.55
NSE3	Q05541	MCM1	YMR043W	861 nt		5.39	□□□□□ -1.55
NSE3	Q05541	YNL035C	YNL035C	1170 nt		5.39	□□□□□ -1.55
NSE3	Q05541	COM2	YER130C	1332 nt		5.39	□□□□□ -1.55
NSE3	Q05541	YNR066C	YNR066C	1311 nt		5.39	□□□□□ -1.55
NSE3	Q05541	ABF1	YKL112W	2196 nt		5.39	□□□□□ -1.55
NSE3	Q05541	KRE6	YPR159W	2163 nt		5.39	□□□□□ -1.55
NSE3	Q05541	CDC48	YDL126C	2508 nt		5.38	□□□□□ -1.55
NSE3	Q05541	EXO1	YOR033C	2109 nt		5.38	□□□□□ -1.55
NSE3	Q05541	TOS3	YGL179C	1683 nt		5.38	□□□□□ -1.55
NSE3	Q05541	AGA1	YNR044W	2178 nt		5.38	□□□□□ -1.55
NSE3	Q05541	DET1	YDR051C	1005 nt		5.38	□□□□□ -1.55
NSE3	Q05541	NBP2	YDR162C	711 nt		5.38	□□□□□ -1.55
NSE3	Q05541	RPL22B	YFL034C-A	369 nt		5.38	□□□□□ -1.55
NSE3	Q05541	RPS4B	YHR203C	786 nt		5.38	□□□□□ -1.55
NSE3	Q05541	YJL156W-A	YJL156W-A	222 nt		5.38	□□□□□ -1.55
NSE3	Q05541	RPS4A	YJR145C	786 nt		5.38	□□□□□ -1.55
NSE3	Q05541	IRC25	YLR021W	540 nt		5.38	□□□□□ -1.55
NSE3	Q05541	VPS69	YPR087W	321 nt		5.38	□□□□□ -1.55
NSE3	Q05541	MPS3	YJL019W	2049 nt		5.38	□□□□□ -1.55
NSE3	Q05541	ASK10	YGR097W	3441 nt		5.38	□□□□□ -1.55
NSE3	Q05541	CDC4	YFL009W	2340 nt		5.37	□□□□□ -1.55
NSE3	Q05541	UBC5	YDR059C	447 nt		5.37	□□□□□ -1.55
NSE3	Q05541	YGL138C	YGL138C	1038 nt		5.37	□□□□□ -1.55
NSE3	Q05541	COS12	YGL263W	1143 nt		5.37	□□□□□ -1.55
NSE3	Q05541	YIR023C-A	YIR023C-A	324 nt		5.37	□□□□□ -1.55
NSE3	Q05541	RFU1	YLR073C	603 nt		5.37	□□□□□ -1.55
NSE3	Q05541	SAM37	YMR060C	984 nt		5.37	□□□□□ -1.55
NSE3	Q05541	YMR085W	YMR085W	1299 nt		5.37	□□□□□ -1.55
NSE3	Q05541	TRI1	YMR233W	681 nt		5.37	□□□□□ -1.55
NSE3	Q05541	DUG3	YNL191W	1074 nt		5.37	□□□□□ -1.55
NSE3	Q05541	COX11	YPL132W	903 nt		5.37	□□□□□ -1.55
NSE3	Q05541	BCH2	YKR027W	2298 nt		5.37	□□□□□ -1.55
NSE3	Q05541	AXL2	YIL140W	2472 nt		5.37	□□□□□ -1.55
NSE3	Q05541	BBC1	YJL020C	3474 nt		5.37	□□□□□ -1.55
NSE3	Q05541	APN2	YBL019W	1563 nt		5.37	□□□□□ -1.55
NSE3	Q05541	YER158C	YER158C	1722 nt		5.37	□□□□□ -1.55
NSE3	Q05541	THS1	YIL078W	2205 nt		5.36	□□□□□ -1.55

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