Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 COX2Q0250 756 nt4.05□□□□□ -1.76
SEC28P40509 YJR038CYJR038C 363 nt4.05□□□□□ -1.76
SEC28P40509 CDC73YLR418C 1182 nt4.05□□□□□ -1.76
SEC28P40509 RAD10YML095C 633 nt4.05□□□□□ -1.76
SEC28P40509 DDP1YOR163W 567 nt4.05□□□□□ -1.76
SEC28P40509 ARO80YDR421W 2853 nt4.05□□□□□ -1.76
SEC28P40509 MGR3YMR115W 1506 nt4.05□□□□□ -1.76
SEC28P40509 ISW2YOR304W 3363 nt4.05□□□□□ -1.76
SEC28P40509 ULS1YOR191W 4860 nt4.04□□□□□ -1.76
SEC28P40509 MIC26YGR235C 702 nt4.04□□□□□ -1.76
SEC28P40509 RPS4BYHR203C 786 nt4.04□□□□□ -1.76
SEC28P40509 RPS4AYJR145C 786 nt4.04□□□□□ -1.76
SEC28P40509 KRE5YOR336W 4098 nt4.04□□□□□ -1.76
SEC28P40509 AGA1YNR044W 2178 nt4.04□□□□□ -1.76
SEC28P40509 MEF1YLR069C 2286 nt4.04□□□□□ -1.76
SEC28P40509 UBP12YJL197W 3765 nt4.03□□□□□ -1.76
SEC28P40509 YRM1YOR172W 2361 nt4.03□□□□□ -1.76
SEC28P40509 ACE2YLR131C 2313 nt4.03□□□□□ -1.76
SEC28P40509 NAT1YDL040C 2565 nt4.03□□□□□ -1.76
SEC28P40509 YDR246W-AYDR246W-A 201 nt4.03□□□□□ -1.76
SEC28P40509 FMP10YER182W 735 nt4.03□□□□□ -1.76
SEC28P40509 TOS8YGL096W 831 nt4.03□□□□□ -1.76
SEC28P40509 SSO2YMR183C 888 nt4.03□□□□□ -1.76
SEC28P40509 YOR314WYOR314W 330 nt4.03□□□□□ -1.76
SEC28P40509 MRPL37YBR268W 318 nt4.03□□□□□ -1.76
SEC28P40509 CWH43YCR017C 2862 nt4.03□□□□□ -1.76
SEC28P40509 YFL040WYFL040W 1623 nt4.03□□□□□ -1.77
SEC28P40509 YBR238CYBR238C 2196 nt4.02□□□□□ -1.77
SEC28P40509 KIN2YLR096W 3444 nt4.02□□□□□ -1.77
SEC28P40509 snR63snR63 255 nt4.02□□□□□ -1.77
SEC28P40509 RPS18AYDR450W 441 nt4.02□□□□□ -1.77
SEC28P40509 MRPS35YGR165W 1038 nt4.02□□□□□ -1.77
SEC28P40509 SAY1YGR263C 1275 nt4.02□□□□□ -1.77
SEC28P40509 PER33YLR064W 822 nt4.02□□□□□ -1.77
SEC28P40509 RPL15BYMR121C 615 nt4.02□□□□□ -1.77
SEC28P40509 MVD1YNR043W 1191 nt4.02□□□□□ -1.77
SEC28P40509 NUP85YJR042W 2235 nt4.02□□□□□ -1.77
SEC28P40509 MGA1YGR249W 1371 nt4.02□□□□□ -1.77
SEC28P40509 TRK1YJL129C 3708 nt4.01□□□□□ -1.77
SEC28P40509 YFT2YDR319C 825 nt4.01□□□□□ -1.77
SEC28P40509 CIR1YGR207C 786 nt4.01□□□□□ -1.77
SEC28P40509 HRT3YLR097C 1035 nt4.01□□□□□ -1.77
SEC28P40509 FSH3YOR280C 801 nt4.01□□□□□ -1.77
SEC28P40509 MET17YLR303W 1335 nt4□□□□□ -1.77
SEC28P40509 YPR003CYPR003C 2265 nt4□□□□□ -1.77
SEC28P40509 GRX6YDL010W 696 nt4□□□□□ -1.77
SEC28P40509 HSP42YDR171W 1128 nt4□□□□□ -1.77
SEC28P40509 YMR114CYMR114C 1107 nt4□□□□□ -1.77
SEC28P40509 YBL094CYBL094C 333 nt4□□□□□ -1.77
SEC28P40509 MCM16YPR046W 546 nt4□□□□□ -1.77
SEC28P40509 POF1YCL047C 777 nt4□□□□□ -1.77
SEC28P40509 CIT1YNR001C 1440 nt4□□□□□ -1.77
SEC28P40509 EPO1YMR124W 2832 nt4□□□□□ -1.77
SEC28P40509 VID27YNL212W 2349 nt4□□□□□ -1.77
SEC28P40509 YBR225WYBR225W 2703 nt4□□□□□ -1.77
SEC28P40509 VID28YIL017C 2766 nt3.99□□□□□ -1.77
SEC28P40509 YKL050CYKL050C 2769 nt3.99□□□□□ -1.77
SEC28P40509 YCL076WYCL076W 744 nt3.99□□□□□ -1.77
SEC28P40509 SHU2YDR078C 672 nt3.99□□□□□ -1.77
SEC28P40509 YDR230WYDR230W 348 nt3.99□□□□□ -1.77
SEC28P40509 BIO2YGR286C 1128 nt3.99□□□□□ -1.77
SEC28P40509 RPC17YJL011C 486 nt3.99□□□□□ -1.77
SEC28P40509 MRPL3YMR024W 1173 nt3.99□□□□□ -1.77
SEC28P40509 YNR068CYNR068C 819 nt3.99□□□□□ -1.77
SEC28P40509 YOR131CYOR131C 657 nt3.99□□□□□ -1.77
SEC28P40509 YOR338WYOR338W 1092 nt3.99□□□□□ -1.77
SEC28P40509 GDT1YBR187W 843 nt3.99□□□□□ -1.77
SEC28P40509 SLX1YBR228W 915 nt3.99□□□□□ -1.77
SEC28P40509 UTP25YIL091C 2166 nt3.99□□□□□ -1.77
SEC28P40509 FAS2YPL231W 5664 nt3.98□□□□□ -1.77
SEC28P40509 RIA1YNL163C 3333 nt3.98□□□□□ -1.77
SEC28P40509 REX3YLR107W 1215 nt3.98□□□□□ -1.77
SEC28P40509 YNL181WYNL181W 1224 nt3.98□□□□□ -1.77
SEC28P40509 YPR059CYPR059C 387 nt3.98□□□□□ -1.77
SEC28P40509 YVC1YOR087W 2028 nt3.98□□□□□ -1.77
SEC28P40509 EMC1YCL045C 2283 nt3.98□□□□□ -1.77
SEC28P40509 TAF6YGL112C 1551 nt3.97□□□□□ -1.77
SEC28P40509 MTH1YDR277C 1302 nt3.97□□□□□ -1.77
SEC28P40509 NCR1YPL006W 3513 nt3.97□□□□□ -1.77
SEC28P40509 ELF1YKL160W 438 nt3.97□□□□□ -1.77
SEC28P40509 MCM1YMR043W 861 nt3.97□□□□□ -1.77
SEC28P40509 NRK1YNL129W 723 nt3.97□□□□□ -1.77
SEC28P40509 REX4YOL080C 870 nt3.97□□□□□ -1.77
SEC28P40509 STP22YCL008C 1158 nt3.97□□□□□ -1.77
SEC28P40509 SEC2YNL272C 2280 nt3.97□□□□□ -1.77
SEC28P40509 VHS3YOR054C 2025 nt3.97□□□□□ -1.77
SEC28P40509 PGS1YCL004W 1566 nt3.97□□□□□ -1.77
SEC28P40509 RPO21YDL140C 5202 nt3.97□□□□□ -1.77
SEC28P40509 ARO9YHR137W 1542 nt3.96□□□□□ -1.78
SEC28P40509 RRN7YJL025W 1545 nt3.96□□□□□ -1.78
SEC28P40509 TMA17YDL110C 453 nt3.96□□□□□ -1.78
SEC28P40509 YDL228CYDL228C 642 nt3.96□□□□□ -1.78
SEC28P40509 AIM7YDR063W 450 nt3.96□□□□□ -1.78
SEC28P40509 YDR391CYDR391C 699 nt3.96□□□□□ -1.78
SEC28P40509 YBL010CYBL010C 843 nt3.96□□□□□ -1.78
SEC28P40509 CLG1YGL215W 1359 nt3.96□□□□□ -1.78
SEC28P40509 TPD3YAL016W 1908 nt3.95□□□□□ -1.78
SEC28P40509 USA1YML029W 2517 nt3.95□□□□□ -1.78
SEC28P40509 PTA1YAL043C 2358 nt3.95□□□□□ -1.78
SEC28P40509 ORC4YPR162C 1590 nt3.95□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 45.4 ms