Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEFLP07196 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEFLP07196 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEFLP07196 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEFLP07196 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NEFLP07196 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NEFLP07196 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NEFLP07196 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEFLP07196 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEFLP07196 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEFLP07196 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEFLP07196 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEFLP07196 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEFLP07196 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEFLP07196 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEFLP07196 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEFLP07196 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEFLP07196 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEFLP07196 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEFLP07196 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEFLP07196 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NEFLP07196 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEFLP07196 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEFLP07196 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEFLP07196 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEFLP07196 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEFLP07196 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEFLP07196 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NEFLP07196 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEFLP07196 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEFLP07196 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEFLP07196 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEFLP07196 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEFLP07196 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEFLP07196 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEFLP07196 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEFLP07196 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEFLP07196 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEFLP07196 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NEFLP07196 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEFLP07196 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEFLP07196 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEFLP07196 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEFLP07196 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEFLP07196 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NEFLP07196 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEFLP07196 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEFLP07196 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEFLP07196 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NEFLP07196 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEFLP07196 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEFLP07196 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEFLP07196 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEFLP07196 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEFLP07196 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEFLP07196 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NEFLP07196 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEFLP07196 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEFLP07196 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEFLP07196 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEFLP07196 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEFLP07196 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEFLP07196 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEFLP07196 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEFLP07196 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEFLP07196 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEFLP07196 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEFLP07196 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NEFLP07196 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEFLP07196 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEFLP07196 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NEFLP07196 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEFLP07196 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEFLP07196 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEFLP07196 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NEFLP07196 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEFLP07196 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEFLP07196 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEFLP07196 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEFLP07196 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEFLP07196 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEFLP07196 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEFLP07196 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEFLP07196 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEFLP07196 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NEFLP07196 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NEFLP07196 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NEFLP07196 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NEFLP07196 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NEFLP07196 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEFLP07196 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEFLP07196 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEFLP07196 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEFLP07196 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEFLP07196 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEFLP07196 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEFLP07196 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEFLP07196 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NEFLP07196 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NEFLP07196 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms