Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ITGB3P05106 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGB3P05106 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms