Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCNE2O96020 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms