Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KDM4AO75164 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KDM4AO75164 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms