Protein–RNA interactions for Protein: E7EW31

PROB1, Proline-rich basic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROB1E7EW31 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
PROB1E7EW31 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PROB1E7EW31 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PROB1E7EW31 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PROB1E7EW31 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PROB1E7EW31 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PROB1E7EW31 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PROB1E7EW31 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PROB1E7EW31 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PROB1E7EW31 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PROB1E7EW31 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PROB1E7EW31 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PROB1E7EW31 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROB1E7EW31 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROB1E7EW31 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROB1E7EW31 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROB1E7EW31 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROB1E7EW31 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROB1E7EW31 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROB1E7EW31 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROB1E7EW31 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROB1E7EW31 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROB1E7EW31 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PROB1E7EW31 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROB1E7EW31 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PROB1E7EW31 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PROB1E7EW31 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PROB1E7EW31 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PROB1E7EW31 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms