Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYVE1Q9Y5Y7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms