Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
LRRC4BQ9NT99 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LRRC4BQ9NT99 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC4BQ9NT99 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC4BQ9NT99 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC4BQ9NT99 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC4BQ9NT99 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC4BQ9NT99 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC4BQ9NT99 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC4BQ9NT99 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC4BQ9NT99 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC4BQ9NT99 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC4BQ9NT99 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC4BQ9NT99 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC4BQ9NT99 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms