Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IL1RAPQ9NPH3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IL1RAPQ9NPH3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IL1RAPQ9NPH3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IL1RAPQ9NPH3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IL1RAPQ9NPH3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IL1RAPQ9NPH3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IL1RAPQ9NPH3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IL1RAPQ9NPH3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IL1RAPQ9NPH3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IL1RAPQ9NPH3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IL1RAPQ9NPH3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IL1RAPQ9NPH3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IL1RAPQ9NPH3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IL1RAPQ9NPH3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IL1RAPQ9NPH3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IL1RAPQ9NPH3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
IL1RAPQ9NPH3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IL1RAPQ9NPH3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
IL1RAPQ9NPH3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IL1RAPQ9NPH3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
IL1RAPQ9NPH3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IL1RAPQ9NPH3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IL1RAPQ9NPH3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IL1RAPQ9NPH3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IL1RAPQ9NPH3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IL1RAPQ9NPH3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IL1RAPQ9NPH3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IL1RAPQ9NPH3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IL1RAPQ9NPH3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IL1RAPQ9NPH3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IL1RAPQ9NPH3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IL1RAPQ9NPH3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IL1RAPQ9NPH3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IL1RAPQ9NPH3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IL1RAPQ9NPH3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IL1RAPQ9NPH3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IL1RAPQ9NPH3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
IL1RAPQ9NPH3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IL1RAPQ9NPH3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IL1RAPQ9NPH3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
IL1RAPQ9NPH3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IL1RAPQ9NPH3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms