Protein–RNA interactions for Protein: Q99608

NDN, Necdin, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDNQ99608 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDNQ99608 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDNQ99608 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDNQ99608 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDNQ99608 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDNQ99608 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDNQ99608 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDNQ99608 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDNQ99608 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDNQ99608 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NDNQ99608 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NDNQ99608 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDNQ99608 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDNQ99608 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NDNQ99608 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDNQ99608 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDNQ99608 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDNQ99608 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDNQ99608 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDNQ99608 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDNQ99608 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDNQ99608 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDNQ99608 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDNQ99608 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDNQ99608 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NDNQ99608 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDNQ99608 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDNQ99608 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDNQ99608 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDNQ99608 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDNQ99608 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDNQ99608 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDNQ99608 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NDNQ99608 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDNQ99608 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDNQ99608 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDNQ99608 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDNQ99608 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDNQ99608 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDNQ99608 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDNQ99608 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDNQ99608 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDNQ99608 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDNQ99608 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDNQ99608 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDNQ99608 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDNQ99608 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NDNQ99608 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDNQ99608 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDNQ99608 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDNQ99608 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDNQ99608 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDNQ99608 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDNQ99608 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDNQ99608 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDNQ99608 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDNQ99608 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDNQ99608 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDNQ99608 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDNQ99608 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NDNQ99608 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDNQ99608 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDNQ99608 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDNQ99608 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDNQ99608 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDNQ99608 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDNQ99608 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NDNQ99608 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDNQ99608 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDNQ99608 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDNQ99608 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDNQ99608 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDNQ99608 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDNQ99608 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDNQ99608 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDNQ99608 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDNQ99608 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NDNQ99608 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NDNQ99608 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NDNQ99608 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NDNQ99608 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDNQ99608 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDNQ99608 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDNQ99608 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDNQ99608 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDNQ99608 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDNQ99608 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDNQ99608 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDNQ99608 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NDNQ99608 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDNQ99608 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDNQ99608 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NDNQ99608 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDNQ99608 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDNQ99608 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDNQ99608 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDNQ99608 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDNQ99608 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NDNQ99608 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NDNQ99608 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms