Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHE23Q8NDY6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BHLHE23Q8NDY6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms