Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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USP30Q70CQ3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP30Q70CQ3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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USP30Q70CQ3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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USP30Q70CQ3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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USP30Q70CQ3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
USP30Q70CQ3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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