Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CSHL1Q14406 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CSHL1Q14406 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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