Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NPRL3Q12980 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NPRL3Q12980 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPRL3Q12980 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPRL3Q12980 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NPRL3Q12980 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms