Protein–RNA interactions for Protein: Q07807

PUF3, mRNA-binding protein PUF3, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF3Q07807 SNO2YNL334C 669 nt5.55□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 YOR029WYOR029W 336 nt5.55□□□□□ -1.52 RIP-Chip
PUF3Q07807 TOA1YOR194C 861 nt5.55□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 VID24YBR105C 1089 nt5.55□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 YSY6YBR162W-A 198 nt5.55□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 POP7YBR167C 423 nt5.55□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 PRT1YOR361C 2292 nt5.55□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 UBX2YML013W 1755 nt5.55□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 ENT1YDL161W 1365 nt5.55□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 ADY2YCR010C 852 nt5.54□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 EFM4YIL064W 774 nt5.54□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 YLR444CYLR444C 303 nt5.54□□□□□ -1.52 RIP-Chip
PUF3Q07807 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt5.54□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 MRPL17YNL252C 846 nt5.54□□□□□ -1.52 RIP-Chip
PUF3Q07807 NRM1YNR009W 750 nt5.54□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 YBL096CYBL096C 309 nt5.54□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 FYV12YOR183W 390 nt5.54□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 RCN2YOR220W 798 nt5.54□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 POL30YBR088C 777 nt5.54□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 MNN2YBR015C 1794 nt5.54□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 RAD53YPL153C 2466 nt5.54□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 FAA4YMR246W 2085 nt5.54□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 YHR202WYHR202W 1809 nt5.53□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 DTD1YDL219W 453 nt5.53□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 YER181CYER181C 324 nt5.53□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 YGL109WYGL109W 324 nt5.53□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 YLR217WYLR217W 324 nt5.53□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 SAM37YMR060C 984 nt5.53□□□□□ -1.52 RIP-Chip
PUF3Q07807 SPS18YNL204C 903 nt5.53□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 MED7YOL135C 669 nt5.53□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 RPL3YOR063W 1164 nt5.53□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 NOT3YIL038C 2511 nt5.53□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 YFL034WYFL034W 3222 nt5.53□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 PRM2YIL037C 1971 nt5.53□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 BUD14YAR014C 2130 nt5.53□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 SIA1YOR137C 1869 nt5.52□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 NPL4YBR170C 1743 nt5.52□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 SHU2YDR078C 672 nt5.52□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 GTF1YGR102C 552 nt5.52□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 YGR149WYGR149W 1299 nt5.52□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 PUS6YGR169C 1215 nt5.52□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 YPT52YKR014C 705 nt5.52□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 YMR082CYMR082C 357 nt5.52□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 DDR48YMR173W 1293 nt5.52□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 YNL122CYNL122C 348 nt5.52□□□□□ -1.53 RIP-Chip
PUF3Q07807 RPA49YNL248C 1248 nt5.52□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 snR32snR32 188 nt5.52□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 RIB5YBR256C 717 nt5.52□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 VTC2YFL004W 2487 nt5.52□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 YIG1YPL201C 1386 nt5.52□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 DBP9YLR276C 1785 nt5.52□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 PHO8YDR481C 1701 nt5.51□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 ADY3YDL239C 2373 nt5.51□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 ALG9YNL219C 1668 nt5.51□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 RHB1YCR027C 630 nt5.51□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 RPL13AYDL082W 600 nt5.51□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 PEX10YDR265W 1014 nt5.51□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 YDR366CYDR366C 399 nt5.51□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 YGL199CYGL199C 471 nt5.51□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 ILM1YJR118C 612 nt5.51□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 YLR101CYLR101C 396 nt5.51□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 IRC21YMR073C 606 nt5.51□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 YBL059WYBL059W 582 nt5.51□□□□□ -1.53 RIP-Chip
PUF3Q07807 PEX15YOL044W 1152 nt5.51□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 YPL077CYPL077C 723 nt5.51□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 MRPL40YPL173W 894 nt5.51□□□□□ -1.53 RIP-Chip
PUF3Q07807 MRPS9YBR146W 837 nt5.51□□□□□ -1.53 RIP-Chip
PUF3Q07807 GDS1YOR355W 1569 nt5.5□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 TDA6YPR157W 1404 nt5.5□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 YGL036WYGL036W 2730 nt5.5□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 APE1YKL103C 1545 nt5.5□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 SIR1YKR101W 1965 nt5.5□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 YDL050CYDL050C 372 nt5.5□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 ARG82YDR173C 1068 nt5.5□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 BUD25YER014C-A 462 nt5.5□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 YER133W-AYER133W-A 342 nt5.5□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 IKI1YHR187W 930 nt5.5□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 YAL069WYAL069W 315 nt5.5□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 YLR296WYLR296W 327 nt5.5□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 RET3YPL010W 570 nt5.5□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 ERI1YPL096C-A 207 nt5.5□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 SAM4YPL273W 978 nt5.5□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 CDC28YBR160W 897 nt5.5□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 YCL002CYCL002C 792 nt5.5□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 NTA1YJR062C 1374 nt5.5□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 RAT1YOR048C 3021 nt5.5□□□□□ -1.53 RIP-Chip
PUF3Q07807 CNA1YLR433C 1662 nt5.5□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 YDR114CYDR114C 303 nt5.49□□□□□ -1.53 RIP-Chip
PUF3Q07807 RUB1YDR139C 234 nt5.49□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 YDR248CYDR248C 582 nt5.49□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 VPS74YDR372C 1038 nt5.49□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt5.49□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt5.49□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 SVP26YHR181W 687 nt5.49□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 LOH1YJL038C 660 nt5.49□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 YKL151CYKL151C 1014 nt5.49□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 BET3YKR068C 582 nt5.49□□□□□ -1.53
PUF3Q07807 FYV7YLR068W 456 nt5.49□□□□□ -1.53 RIP-Chip
PUF3Q07807 YML084WYML084W 309 nt5.49□□□□□ -1.53 RIP-Chip
PUF3Q07807 MRPL3YMR024W 1173 nt5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.3 ms