Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
ITGAEP38570 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms