Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMO2P25791 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMO2P25791 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LMO2P25791 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMO2P25791 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMO2P25791 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LMO2P25791 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMO2P25791 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMO2P25791 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMO2P25791 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMO2P25791 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMO2P25791 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMO2P25791 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMO2P25791 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMO2P25791 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMO2P25791 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMO2P25791 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMO2P25791 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMO2P25791 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMO2P25791 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMO2P25791 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMO2P25791 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LMO2P25791 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMO2P25791 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMO2P25791 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMO2P25791 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMO2P25791 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMO2P25791 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LMO2P25791 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMO2P25791 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMO2P25791 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMO2P25791 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMO2P25791 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMO2P25791 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMO2P25791 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMO2P25791 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO2P25791 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO2P25791 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO2P25791 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO2P25791 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO2P25791 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO2P25791 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO2P25791 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO2P25791 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO2P25791 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO2P25791 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO2P25791 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO2P25791 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO2P25791 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO2P25791 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO2P25791 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO2P25791 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO2P25791 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMO2P25791 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMO2P25791 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMO2P25791 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMO2P25791 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMO2P25791 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMO2P25791 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMO2P25791 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMO2P25791 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMO2P25791 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMO2P25791 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMO2P25791 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMO2P25791 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMO2P25791 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMO2P25791 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMO2P25791 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMO2P25791 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMO2P25791 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMO2P25791 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LMO2P25791 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMO2P25791 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMO2P25791 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMO2P25791 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMO2P25791 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMO2P25791 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMO2P25791 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMO2P25791 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMO2P25791 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMO2P25791 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMO2P25791 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMO2P25791 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMO2P25791 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMO2P25791 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMO2P25791 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMO2P25791 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMO2P25791 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMO2P25791 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMO2P25791 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMO2P25791 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMO2P25791 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMO2P25791 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMO2P25791 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMO2P25791 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LMO2P25791 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMO2P25791 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMO2P25791 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LMO2P25791 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LMO2P25791 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms