Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LYL1P12980 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LYL1P12980 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LYL1P12980 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LYL1P12980 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LYL1P12980 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LYL1P12980 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LYL1P12980 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LYL1P12980 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LYL1P12980 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LYL1P12980 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LYL1P12980 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LYL1P12980 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LYL1P12980 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LYL1P12980 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LYL1P12980 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LYL1P12980 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LYL1P12980 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LYL1P12980 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LYL1P12980 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LYL1P12980 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LYL1P12980 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LYL1P12980 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LYL1P12980 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LYL1P12980 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LYL1P12980 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LYL1P12980 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LYL1P12980 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LYL1P12980 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LYL1P12980 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LYL1P12980 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LYL1P12980 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LYL1P12980 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LYL1P12980 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LYL1P12980 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LYL1P12980 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LYL1P12980 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LYL1P12980 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LYL1P12980 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LYL1P12980 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LYL1P12980 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LYL1P12980 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LYL1P12980 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LYL1P12980 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LYL1P12980 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LYL1P12980 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LYL1P12980 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LYL1P12980 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LYL1P12980 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LYL1P12980 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LYL1P12980 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LYL1P12980 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LYL1P12980 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LYL1P12980 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LYL1P12980 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LYL1P12980 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LYL1P12980 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LYL1P12980 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LYL1P12980 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LYL1P12980 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LYL1P12980 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LYL1P12980 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LYL1P12980 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LYL1P12980 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LYL1P12980 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LYL1P12980 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LYL1P12980 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LYL1P12980 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LYL1P12980 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LYL1P12980 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LYL1P12980 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LYL1P12980 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LYL1P12980 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LYL1P12980 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LYL1P12980 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LYL1P12980 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LYL1P12980 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LYL1P12980 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LYL1P12980 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LYL1P12980 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LYL1P12980 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LYL1P12980 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LYL1P12980 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LYL1P12980 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYL1P12980 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYL1P12980 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYL1P12980 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYL1P12980 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYL1P12980 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYL1P12980 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LYL1P12980 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYL1P12980 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYL1P12980 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYL1P12980 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYL1P12980 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYL1P12980 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYL1P12980 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYL1P12980 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYL1P12980 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LYL1P12980 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms