Protein–RNA interactions for Protein: P11309

PIM1, Serine/threonine-protein kinase pim-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIM1P11309 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIM1P11309 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIM1P11309 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIM1P11309 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIM1P11309 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIM1P11309 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIM1P11309 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIM1P11309 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIM1P11309 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIM1P11309 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIM1P11309 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIM1P11309 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIM1P11309 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PIM1P11309 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIM1P11309 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIM1P11309 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIM1P11309 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIM1P11309 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIM1P11309 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIM1P11309 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIM1P11309 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIM1P11309 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PIM1P11309 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIM1P11309 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIM1P11309 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PIM1P11309 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PIM1P11309 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PIM1P11309 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIM1P11309 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIM1P11309 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIM1P11309 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIM1P11309 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIM1P11309 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIM1P11309 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIM1P11309 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIM1P11309 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIM1P11309 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIM1P11309 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIM1P11309 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIM1P11309 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIM1P11309 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIM1P11309 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIM1P11309 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIM1P11309 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIM1P11309 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PIM1P11309 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIM1P11309 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIM1P11309 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIM1P11309 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIM1P11309 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIM1P11309 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIM1P11309 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PIM1P11309 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIM1P11309 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIM1P11309 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIM1P11309 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIM1P11309 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIM1P11309 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIM1P11309 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIM1P11309 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIM1P11309 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIM1P11309 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIM1P11309 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIM1P11309 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PIM1P11309 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIM1P11309 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIM1P11309 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIM1P11309 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIM1P11309 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PIM1P11309 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIM1P11309 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIM1P11309 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIM1P11309 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIM1P11309 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIM1P11309 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PIM1P11309 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PIM1P11309 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIM1P11309 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIM1P11309 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIM1P11309 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIM1P11309 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIM1P11309 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIM1P11309 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIM1P11309 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIM1P11309 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIM1P11309 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIM1P11309 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIM1P11309 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIM1P11309 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIM1P11309 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIM1P11309 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIM1P11309 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIM1P11309 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIM1P11309 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PIM1P11309 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PIM1P11309 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIM1P11309 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIM1P11309 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PIM1P11309 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PIM1P11309 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.8 ms