Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
IGSF3O75054 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IGSF3O75054 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms