Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA6L9A6NEM1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms