Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NOP58Q9Y2X3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NOP58Q9Y2X3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms