Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP8A1Q9Y2Q0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP8A1Q9Y2Q0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms