Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHA12Q9UN75 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHA12Q9UN75 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms