Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CLEC4AQ9UMR7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLEC4AQ9UMR7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms