Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX79

STRA6, Stimulated by retinoic acid gene 6 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRA6Q9BX79 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
STRA6Q9BX79 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
STRA6Q9BX79 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
STRA6Q9BX79 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
STRA6Q9BX79 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
STRA6Q9BX79 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRA6Q9BX79 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRA6Q9BX79 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRA6Q9BX79 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
STRA6Q9BX79 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRA6Q9BX79 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRA6Q9BX79 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
STRA6Q9BX79 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRA6Q9BX79 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
STRA6Q9BX79 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
STRA6Q9BX79 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRA6Q9BX79 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRA6Q9BX79 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRA6Q9BX79 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRA6Q9BX79 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRA6Q9BX79 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
STRA6Q9BX79 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRA6Q9BX79 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRA6Q9BX79 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRA6Q9BX79 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRA6Q9BX79 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
STRA6Q9BX79 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRA6Q9BX79 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRA6Q9BX79 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
STRA6Q9BX79 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRA6Q9BX79 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms