Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EFHD1Q9BUP0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFHD1Q9BUP0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms