Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GORASP1Q9BQQ3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GORASP1Q9BQQ3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms