Protein–RNA interactions for Protein: Q99700

ATXN2, Ataxin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN2Q99700 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATXN2Q99700 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATXN2Q99700 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms