Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPTQ96BT3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CENPTQ96BT3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPTQ96BT3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms