Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ3

TRIM43, Tripartite motif-containing protein 43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43Q96BQ3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM43Q96BQ3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM43Q96BQ3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM43Q96BQ3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM43Q96BQ3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM43Q96BQ3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM43Q96BQ3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM43Q96BQ3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms