Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF12Q8WXF0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms