Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
DTX3LQ8TDB6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms