Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIW4

FIGNL1, Fidgetin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FIGNL1Q6PIW4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FIGNL1Q6PIW4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FIGNL1Q6PIW4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FIGNL1Q6PIW4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FIGNL1Q6PIW4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FIGNL1Q6PIW4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FIGNL1Q6PIW4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FIGNL1Q6PIW4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FIGNL1Q6PIW4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FIGNL1Q6PIW4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FIGNL1Q6PIW4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FIGNL1Q6PIW4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FIGNL1Q6PIW4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FIGNL1Q6PIW4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FIGNL1Q6PIW4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
FIGNL1Q6PIW4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FIGNL1Q6PIW4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FIGNL1Q6PIW4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FIGNL1Q6PIW4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FIGNL1Q6PIW4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FIGNL1Q6PIW4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FIGNL1Q6PIW4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FIGNL1Q6PIW4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms