Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD1

TIMM23B, Putative mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim23B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM23BQ5SRD1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TIMM23BQ5SRD1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms