Protein–RNA interactions for Protein: Q56NI9

ESCO2, N-acetyltransferase ESCO2, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESCO2Q56NI9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ESCO2Q56NI9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ESCO2Q56NI9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117 ms