Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ME3Q16798 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ME3Q16798 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ME3Q16798 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ME3Q16798 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ME3Q16798 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ME3Q16798 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ME3Q16798 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ME3Q16798 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ME3Q16798 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ME3Q16798 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ME3Q16798 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ME3Q16798 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ME3Q16798 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ME3Q16798 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ME3Q16798 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ME3Q16798 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ME3Q16798 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ME3Q16798 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ME3Q16798 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ME3Q16798 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ME3Q16798 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ME3Q16798 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ME3Q16798 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ME3Q16798 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ME3Q16798 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ME3Q16798 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ME3Q16798 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ME3Q16798 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ME3Q16798 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ME3Q16798 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ME3Q16798 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ME3Q16798 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ME3Q16798 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ME3Q16798 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ME3Q16798 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ME3Q16798 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ME3Q16798 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ME3Q16798 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ME3Q16798 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ME3Q16798 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ME3Q16798 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ME3Q16798 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ME3Q16798 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ME3Q16798 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ME3Q16798 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ME3Q16798 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ME3Q16798 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ME3Q16798 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ME3Q16798 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ME3Q16798 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ME3Q16798 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ME3Q16798 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ME3Q16798 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ME3Q16798 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ME3Q16798 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ME3Q16798 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ME3Q16798 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ME3Q16798 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ME3Q16798 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ME3Q16798 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ME3Q16798 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ME3Q16798 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ME3Q16798 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ME3Q16798 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ME3Q16798 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ME3Q16798 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ME3Q16798 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ME3Q16798 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ME3Q16798 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ME3Q16798 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ME3Q16798 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ME3Q16798 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ME3Q16798 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ME3Q16798 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ME3Q16798 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ME3Q16798 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ME3Q16798 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ME3Q16798 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ME3Q16798 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ME3Q16798 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ME3Q16798 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ME3Q16798 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ME3Q16798 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ME3Q16798 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ME3Q16798 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ME3Q16798 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ME3Q16798 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ME3Q16798 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ME3Q16798 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ME3Q16798 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ME3Q16798 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ME3Q16798 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ME3Q16798 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ME3Q16798 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ME3Q16798 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ME3Q16798 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ME3Q16798 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ME3Q16798 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ME3Q16798 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
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