Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NEDD8Q15843 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NEDD8Q15843 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NEDD8Q15843 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NEDD8Q15843 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NEDD8Q15843 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NEDD8Q15843 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NEDD8Q15843 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8Q15843 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8Q15843 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8Q15843 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8Q15843 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8Q15843 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8Q15843 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8Q15843 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8Q15843 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8Q15843 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8Q15843 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8Q15843 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8Q15843 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD8Q15843 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD8Q15843 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD8Q15843 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NEDD8Q15843 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NEDD8Q15843 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NEDD8Q15843 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
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