Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNX3Q13761 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNX3Q13761 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNX3Q13761 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
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