Protein–RNA interactions for Protein: Q07807

PUF3, mRNA-binding protein PUF3, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF3Q07807 TRI1YMR233W 681 nt5.63□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 MCA1YOR197W 1299 nt5.63□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 HSP104YLL026W 2727 nt5.63□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 VAN1YML115C 1608 nt5.63□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 SPT15YER148W 723 nt5.62□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 YHR173CYHR173C 339 nt5.62□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 YHR214WYHR214W 612 nt5.62□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 VMA5YKL080W 1179 nt5.62□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 YAR066WYAR066W 612 nt5.62□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt5.62□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 ADD37YMR184W 597 nt5.62□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 RPS19BYNL302C 435 nt5.62□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 CDC21YOR074C 915 nt5.62□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 DGA1YOR245C 1257 nt5.62□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 YOR263CYOR263C 408 nt5.62□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 NRG2YBR066C 663 nt5.62□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 ULA1YPL003W 1389 nt5.62□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 FHL1YPR104C 2811 nt5.62□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 BRF1YGR246C 1791 nt5.62□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 STE12YHR084W 2067 nt5.62□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 OXP1YKL215C 3861 nt5.61□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 MEI4YER044C-A 1227 nt5.61□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 YER165C-AYER165C-A 357 nt5.61□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 BRR6YGL247W 594 nt5.61□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 YGR064WYGR064W 369 nt5.61□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 IDS2YJL146W 1410 nt5.61□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 YMR1YJR110W 2067 nt5.61□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 YKL023WYKL023W 834 nt5.61□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 GAS2YLR343W 1668 nt5.61□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 RTT106YNL206C 1368 nt5.61□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 YAP1801YHR161C 1914 nt5.6□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 SPO1YNL012W 1896 nt5.6□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 LCB2YDR062W 1686 nt5.6□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 MET7YOR241W 1647 nt5.6□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 TIM54YJL054W 1437 nt5.6□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 CWC21YDR482C 408 nt5.6□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 NOP16YER002W 696 nt5.6□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 MST27YGL051W 705 nt5.6□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 YGL204CYGL204C 306 nt5.6□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 PGU1YJR153W 1086 nt5.6□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 MST28YAR033W 705 nt5.6□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 ELO3YLR372W 1038 nt5.6□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 LEM3YNL323W 1245 nt5.6□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 MIX23YBL107C 591 nt5.6□□□□□ -1.51 RIP-Chip
PUF3Q07807 YBR051WYBR051W 351 nt5.6□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 CBC2YPL178W 627 nt5.6□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 RPS9BYBR189W 588 nt5.6□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 MRE11YMR224C 2079 nt5.6□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 TMA64YDR117C 1698 nt5.59□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 CTS2YDR371W 1536 nt5.59□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 YIR007WYIR007W 2295 nt5.59□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 VPS38YLR360W 1320 nt5.59□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 GCS1YDL226C 1059 nt5.59□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 ASP1YDR321W 1146 nt5.59□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 SDT1YGL224C 843 nt5.59□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 MTC2YKL098W 1074 nt5.59□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt5.59□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 SSO2YMR183C 888 nt5.59□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt5.59□□□□□ -1.51 RIP-Chip
PUF3Q07807 SWM2YNR004W 441 nt5.59□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 MEI5YPL121C 669 nt5.59□□□□□ -1.51 RIP-Chip
PUF3Q07807 NSI1YDR026C 1713 nt5.59□□□□□ -1.51
PUF3Q07807 QDR1YIL120W 1692 nt5.59□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 ROG3YFR022W 2202 nt5.59□□□□□ -1.52 RIP-Chip
PUF3Q07807 YFL040WYFL040W 1623 nt5.59□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 DPH2YKL191W 1605 nt5.59□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 YMD8YML038C 1329 nt5.58□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 TRM11YOL124C 1302 nt5.58□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 ECM11YDR446W 909 nt5.58□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 CIA2YHR122W 696 nt5.58□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 SPR2YOR214C 711 nt5.58□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 KIP2YPL155C 2121 nt5.58□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 PDC1YLR044C 1692 nt5.58□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 ABZ1YNR033W 2364 nt5.58□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 RSC30YHR056C 2652 nt5.58□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 NOP8YOL144W 1455 nt5.58□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 RPT4YOR259C 1314 nt5.57□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 OST5YGL226C-A 261 nt5.57□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 VPS71YML041C 843 nt5.57□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 PRM6YML047C 1059 nt5.57□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 RRG7YOR305W 729 nt5.57□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 SPC97YHR172W 2472 nt5.57□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 YEL077CYEL077C 3834 nt5.56□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 IML2YJL082W 2196 nt5.56□□□□□ -1.52 RIP-Chip
PUF3Q07807 MGT1YDL200C 567 nt5.56□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 MRPL7YDR237W 879 nt5.56□□□□□ -1.52 RIP-Chip
PUF3Q07807 YER006C-AYER006C-A 318 nt5.56□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 PGD1YGL025C 1194 nt5.56□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 YGL242CYGL242C 546 nt5.56□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 ECI1YLR284C 843 nt5.56□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 SLT2YHR030C 1455 nt5.56□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 GAS5YOL030W 1455 nt5.56□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.55□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 ERP3YDL018C 678 nt5.55□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 YDL183CYDL183C 963 nt5.55□□□□□ -1.52 RIP-Chip
PUF3Q07807 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt5.55□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 SNO3YFL060C 669 nt5.55□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 TYS1YGR185C 1185 nt5.55□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 GRE3YHR104W 984 nt5.55□□□□□ -1.52
PUF3Q07807 SFT1YKL006C-A 294 nt5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.9 ms