Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC24CP53992 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SEC24CP53992 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEC24CP53992 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms