Protein–RNA interactions for Protein: P43358

MAGEA4, Melanoma-associated antigen 4, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA4P43358 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAGEA4P43358 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEA4P43358 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEA4P43358 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEA4P43358 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEA4P43358 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEA4P43358 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEA4P43358 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEA4P43358 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEA4P43358 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEA4P43358 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEA4P43358 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEA4P43358 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEA4P43358 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEA4P43358 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEA4P43358 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEA4P43358 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEA4P43358 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEA4P43358 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEA4P43358 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAGEA4P43358 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEA4P43358 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEA4P43358 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEA4P43358 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEA4P43358 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEA4P43358 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEA4P43358 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEA4P43358 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEA4P43358 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEA4P43358 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEA4P43358 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEA4P43358 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAGEA4P43358 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAGEA4P43358 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAGEA4P43358 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAGEA4P43358 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MAGEA4P43358 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAGEA4P43358 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MAGEA4P43358 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAGEA4P43358 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAGEA4P43358 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAGEA4P43358 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAGEA4P43358 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAGEA4P43358 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms