Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC1A2P43004 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC1A2P43004 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC1A2P43004 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC1A2P43004 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC1A2P43004 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC1A2P43004 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC1A2P43004 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC1A2P43004 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC1A2P43004 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC1A2P43004 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC1A2P43004 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC1A2P43004 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC1A2P43004 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC1A2P43004 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC1A2P43004 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC1A2P43004 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC1A2P43004 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC1A2P43004 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC1A2P43004 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC1A2P43004 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC1A2P43004 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC1A2P43004 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC1A2P43004 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC1A2P43004 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC1A2P43004 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC1A2P43004 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC1A2P43004 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC1A2P43004 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC1A2P43004 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC1A2P43004 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC1A2P43004 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC1A2P43004 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms